MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-8

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020377	GAT	2	6	25	30	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020377	CAA	2	6	44	49	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020377	AACA	2	8	137	144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020377	TCA	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020377	ATAC	2	8	550	557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020377	ATA	2	6	588	593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020377	GTT	2	6	594	599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020377	T	6	6	598	603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020377	A	6	6	660	665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020377	ATT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020377	TTCA	2	8	689	696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020377	TTAT	2	8	726	733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020377	TAAA	2	8	765	772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020377	ATT	2	6	789	794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020377	TTG	2	6	806	811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020377	TAA	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020377	AT	3	6	849	854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020377	TAA	2	6	860	865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020377	A	7	7	1457	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020377	T	6	6	1484	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020377	T	6	6	1505	1510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020377	TAA	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020377	TA	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020377	TAA	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020377	A	6	6	1655	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020377	T	7	7	1699	1705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020377	TAA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020377	A	7	7	1992	1998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020377	A	6	6	2003	2008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020377	GATATA	2	12	2025	2036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020377	A	7	7	2040	2046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020377	AGT	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020377	ATC	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020377	AT	3	6	2108	2113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020377	AAATTT	2	12	2152	2163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020377	A	6	6	2167	2172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020377	TCTT	2	8	2173	2180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020377	AT	3	6	3527	3532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020377	A	6	6	3553	3558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020377	T	6	6	3610	3615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020377	T	9	9	3662	3670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020377	AAAG	2	8	3746	3753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020377	A	7	7	3788	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020377	T	6	6	3826	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020377	ATT	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020377	TC	3	6	3857	3862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020377	T	6	6	4467	4472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020377	GAA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020377	TTA	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020377	CTTT	2	8	4560	4567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020377	TAAA	2	8	4571	4578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020377	CAAG	2	8	4586	4593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020377	CTAA	2	8	4703	4710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020377	ATA	3	9	4716	4724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020377	AG	3	6	4726	4731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020377	ACA	2	6	4739	4744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020377	A	6	6	4753	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020377	AAG	2	6	4761	4766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020377	A	6	6	4771	4776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020377	CAAA	3	12	4784	4795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020377	TA	3	6	4814	4819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020377	A	6	6	4866	4871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020377	T	6	6	5653	5658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020377	AAAC	2	8	5662	5669	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020377	TAT	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020377	AG	3	6	5751	5756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020377	CA	3	6	5765	5770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020377	CCT	2	6	5774	5779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_020377	AAT	2	6	6087	6092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020377	CCG	2	6	7403	7408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020377	CAT	2	6	7598	7603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020377	TCCG	2	8	7620	7627	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020377	TGTA	2	8	7646	7653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020377	TCC	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020377	AT	3	6	7682	7687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020377	CAT	2	6	7888	7893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020377	ATAGA	2	10	7946	7955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020377	ATTC	2	8	7973	7980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020377	A	6	6	7997	8002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020377	GTG	2	6	8039	8044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020377	CT	3	6	8075	8080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020377	A	6	6	8092	8097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020377	GTA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020377	A	7	7	8202	8208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020377	T	6	6	8230	8235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020377	TCA	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.